Работники больницы Сиэтл Грейс узнают о трагической смерти Джорджа. Каждый из них находит свой способ пережить это горе. В больницу приезжает мама Джорджа. Она должна принять тяжелое решение о том, что делать с органами умершего сына.

Несмотря на то, что после смерти Джорджа прошло какое-то время, врачи продолжают скорбеть о своем коллеге. Каждый по-своему пытается отвлечься от грустных мыслей. Мередит и Дерек, похоже, решили выполнять свои супружеские обещания где только можно, а Кристина и Оуэн получили временный запрет на секс от доктора Уайтт.

Иззи возвращается на работу после случая, когда она чуть не умерла. Тем временем, персонал больницы переживает насчет грядущих сокращений, о которых объявил шеф. Ординаторы Сиэтл Грейс пытаются сохранить свои рабочие места, а Кристина начинает работать в педиатрии вместе с Аризоной. И так сложный случай пациентки Бейли и Алекса осложняется из-за ее сына-шизофреника.

Тэтчер попадает в больницу. Ему нужна новая печень, и только Мередит может спасти ему жизнь. Тем временем, Иззи сочувствует пациенту с многочисленными опухолями. Марку надоело то, с каким усердием работает Кристина, чтобы сохранить свое рабочее место, поэтому он уговаривает ее ассистировать на необычной операции.

Произошло объединение Сиэтл Грейс и Мерси Вест, и ординаторы обеих больниц соперничают за каждую операцию, пытаясь спасти свои карьеры. Между тем, Аризона поддерживает Келли, когда ее отец приводит священника, чтобы убедить свою дочь перестать встречаться с женщинами.

В отделении скорой помощи неожиданно умирает пациент, поступивший в больницу с ожогами. Шеф и член правления больницы Дженнингс устраивают ординаторам допрос, чтобы найти виновного в смерти пациента. Все ординаторы Мерси Вест и Сиэтл Грейс оправдывают свои действия и пытаются сохранить рабочие места.

Когда работник лаборатории Айзек узнает, что у него неоперабельная опухоль, которая окутала его позвоночник, он просит Дерека о помощи. Между тем, Ричард запрещает проводить такую опасную операцию, но Дерек готов поспорить с его властью.

Родители маленького пациента Аризоны готовы пожертвовать больнице Сиэтл Грейс большую сумму денег. Но когда состояние ее пациента ухудшается, Аризона мечется между больницей и пациентом. Между тем, Кристина выясняет отношения с Оуэном.

Оуэн нанимает на работу свою коллегу, ветерана войны в Ираке доктора Тедди Алтман, на должность нового кардиохирурга. Иззи возвращается в Сиэтл Грейс со своим бывшим школьным учителем, страдающим слабоумием.

Праздники наступают и заканчиваются. К Миранде приезжает ее отец Уильям, который не одобряет ее жизненные решения. Марку и Лекси предстоит справиться с появлением женщины из его прошлого. Тэтчер Грей сомневается в правильности поведения шефа, а Мередит становится на его защиту.

Марк просит Эддисон приехать в Сиэтл для проведения серьезной операции его беременной дочери. Между тем, Оуэн пытается выяснить у Тедди, почему она назначила Кристину главной на сложной операции. Подозрения Дерека растут, когда Шеф просит Мередит ассистировать ему на важной операции.

Узнав об алкоголизме Ричарда, Дерек вызывает его на серьезный разговор в попытке помочь своему другу и оказать услугу больнице. Иззи возвращается, чтобы помириться с Алексом. Конфликт между Тедди, Кристиной и Оуэном обостряется

Дерека назначили временным шефом больницы, и в первый же день на новой должности он сталкивается с возможным иском против больницы: пациент Мередит и Бейли просыпается прямо во время операции. Тедди отказывается работать с Кристиной, Алекс продолжает работать вместе с Аризоной в педиатрии. Марк избегает разговора с Лекси, которая до сих пор тяжело переживает их разрыв.

В День Святого Валентина в больницу Сиэтл Грейс поступили десятки раненных, в одном из самых романтичных ресторанов города обрушилась крыша. Мередит привыкает к своим новым обязанностям жены главы хирургии, а Дерек - к насыщенному расписанию. Марк и Келли пытаются убедить Слоан сделать так, как будет лучше для ее ребенка.

Дерек возобновляет чтение лекций в больнице. Ричард, Бейли и Келли рассказывают коллегам о самых интересных хирургических случаях в своей практике. Бейли вспоминает времена, когда она была в самом начале своей карьеры. Келли вспоминает больного полиомиелитом, а Ричард - дело, на котором он работал вместе с Эллис Грей. Они лечили пациента с диагнозом GRID, который позже получил название СПИД.

Когда известного хирурга доктора Харпера Эйвери госпитализируют, все врачи очень удивлены тем, что один из них - родственник легенды медицины. Его необычная просьба насчет предстоящей операции вызывает очередную ссору между Дереком и Ричардом. Келли и Аризона помогают Тедди и Марку забыть о своем прошлом и жить дальше.

В больницу Сиэтл Грейс поступает пациент, которому необходима чрезвычайно сложная операция. Ричард в ярости, когда Дерек поручает провести ее Оуэну. Тем временем, Бейли нервно готовится к еще одному свиданию с Беном.

Когда пациентка Тедди просит прекратить лечение и дать ей умереть, она обращается за помощью к Ханту. Эта ситуация вызывает у Ханта воспоминания о его жизни на войне в Ираке и отношениях с Тедди. А в это время Келли и Аризона расходятся во мнениях насчет своего будущего. Ричард привыкает к должности обычного хирурга.

Младшего брата Алекса, Аарона, госпитализируют в больницу Сиэтл Грейс-Мерси Вест с грыжей. Алекс должен получить разрешение Бэйли, чтобы провести эту операцию за счет больницы. Но все еще больше усложняется, когда Аарон рассказывает, что Алекс ни разу не связывался со своей семьей после переезда в Сиэтл. Подробности своего прошлого, которые Алексу так долго удавалось держать в секрете, становятся известны его друзьям и коллегам.

Слоан неожиданно приезжает к Марку домой - у нее начались схватки. Тедди, Марк и все еще ругающиеся Келли и Аризона помогают Слоан родить ребенка, а Марку - пройти процедуру усыновления собственного внука. Тедди узнает, что Дерек пригласил в больницу известного кардиоторакального хирурга Тома Эванса. Она считает, что это - угроза ее дальнейшей работе в Сиэтл Грейс. А в это время команда врачей спасает жизнь капитану краболовного судна, который серьезно ранен огромным крюком для ловли акул.

Бэйли заставляет своих учеников вспомнить об уроках сочувствия и готовит их к тому, что в больницу везут пациента, весом 320 кг, с многочисленными проблемами со здоровьем. Это дело станет для всех настоящим испытанием. Дереку приходится разбираться с претензиями мужа бывшей пациентки больницы, а Кристине - проводить время с дочерью пациентки отделения кардиохирургии. Из-за их общения старые раны Кристины напомнят о себе.

Пожилой пациент был доставлен в отделение скорой помощи из-за проблем с сердцем. Там он неожиданно встречает свою первую любовь, которую доставили в больницу по "скорой" с переломом руки. Их история любви привлекла внимание персонала больницы Сиэтл Грейс. А в это время Карев лечит свою пациентку, проблемную девушку-подростка. Родители привезли свою дочь в больницу для лечения шизофрении. Мередит не выдерживает и решается рассказать Кристине о своих подозрениях насчет Оуэна. Естественно, это не могло не повлиять на саму Кристину.

«Анатомия страсти» завершает сезон двухчасовым «фильмом ужасов». В первом часе под названием «Святилище» в Сиэтл Грейс произойдут события, каких больница еще никогда не видела.

Во втором часе хирургический талант Мередит и Кристины подвергнется невероятному испытанию.